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BridgeDock用扩散桥改进柔性分子对接

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AI 综述

Shikun Feng 等作者提出 BridgeDock,将预训练共折叠骨干网络适配到柔性分子对接:把 apo 到 holo 的构象转变建模为扩散桥,从初始蛋白-配体状态而非高斯噪声开始生成,并引入对齐机制把桥状态映射回预训练模型原有的去噪调度。 论文称,在标准柔性对接基准上,BridgeDock 稳定优于强共折叠基线,且在极少去噪步数下仍保持有效、推理计算高效;论文已被 NeurIPS 2026 接收。

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报道时间线

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11月3日
  1. arXiv · cs.AI
    BridgeDock:用扩散桥驯服生成式共折叠先验做分子对接

    BridgeDock 将预训练共折叠骨干网络适配到柔性对接,把 apo 到 holo 的构象转变建模为扩散桥,从初始蛋白-配体状态而非高斯噪声开始生成。该方法引入对齐机制,将桥状态映射回预训练模型原有的去噪调度,在标准柔性对接基准上稳定优于强共折叠基线。其推理计算高效,在极少去噪步数下仍保持有效,论文已被 NeurIPS 2026 接收。

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